H_alpha = Atom('h')
H_1 = Atom('h')
C_alpha = Atom('c')
O = Atom('o')
H_3 = Atom('h')
H_2 = Atom('h')
N = Atom('n')
C = Atom('c')
bonds = [Bond(N, H_1), Bond(N, H_2), Bond(N, H_3), Bond(N, C_alpha), Bond(C_alpha, H_alpha), Bond(C_alpha, C), Bond(C, O), ]
pdbmap = [('', {'N': N, 'O': O, '2HT': H_2, 'HA': H_alpha, 'CA': C_alpha, '1HT': H_1, '3HT': H_3, 'C': C, }, ), ]
name = 'peptide N terminus'
amber_atom_type = {H_3: 'H', C: 'C', O: 'O', H_alpha: 'HP', H_1: 'H', C_alpha: 'CT', H_2: 'H', N: 'N3', }
pdb_alternative = {'HT1': '1HT', 'HT2': '2HT', 'HT3': '3HT', 'H1': '1HT', 'H3': '3HT', 'H2': '2HT', '2HA': 'HA', 'HA2': 'HA'}
