C = Atom('C')
C_alpha = Atom('CH')
N = Atom('N')
O = Atom('O')
O_2 = Atom('O')
bonds = [Bond(N, C_alpha), Bond(C_alpha, C), Bond(C, O), Bond(C, O_2), ]
pdbmap = [('', {'N': N, 'O1': O, 'O2': O_2, 'CA': C_alpha, 'C': C, }, ), ]
amber_atom_type = {N: 'N', C: 'C', O_2: 'O2', O: 'O2', C_alpha: 'CT', }
pdb_alternative = {'O1': 'O', 'O2': 'OXT', 'HN': 'H', 'OT': 'OXT', 'OT2': 'OXT', 'OT1': 'O', }
name = 'peptide in proline C terminus'
