H_alpha = Atom('h')
C_alpha = Atom('c')
N = Atom('n')
O = Atom('o')
H = Atom('h')
C = Atom('c')
bonds = [Bond(N, H), Bond(N, C_alpha), Bond(C_alpha, H_alpha), Bond(C_alpha, C), Bond(C, O), ]
pdbmap = [('', {'N': N, 'O': O, 'HA': H_alpha, 'CA': C_alpha, 'H': H, 'C': C, }, ), ]
amber_atom_type = {C: 'C', O: 'O', H_alpha: 'H1', C_alpha: 'CT', N: 'N', H: 'H', }
pdb_alternative = {'HA2': 'HA', '2HA': 'HA', 'HN': 'H', }
name = 'peptide'
