
SAGA FORMAT
alignement  1rthA_ref1.t_coffee_aln10 nseq=5 len=550
T_COFFEE ALIGNMENT
CPU TIME:72678



pol_sivai sqieetkvqlkegkdgpklkqwplsrekiealteickqmeeegklsrigg
pol_sivgb --ipitkvklkpgvdgprikqwplskekivglqkicdrleeegkisrvdp
pol_fivpe --ipvvkvkmkdpnkgpqikqwpltnekiealteiverlekegkvkrads
pol_caevc --ipitkvklkegctgphvpqwplteeklkglteiidklveegklgkapp
pol_biv27 ekieplpvkvrgp--gpkvpqwpltkekyqalkeivkdllaegkiseaaw

pol_sivai enpyntpvfaikkkdktqwrmlvdfrelnkatqdffevqlgiphpaglqk
pol_sivgb gnnyntpifaikkkdknewrklidfrelnkltqdfhelqlgiphpagikk
pol_fivpe nnpwntpvfaikkks-gkwrmlidfrelnkltekgaevqlglphpaglqi
pol_caevc hwtcntpifcikkks-gkwrmlidfrelnkqtedlteaqlglphpgglqk
pol_biv27 dnpyntpvfvikkkgtgrwrmlmdfrelnkitvkgqefstglpyppgike

pol_sivai kkqitvidigdayysiplckefrkytaftipsvnntgpgiryqfnclpqg
pol_sivgb ckritvldigdayfsipldpdyrpytaftvpsvnnqapgkrymynvlpqg
pol_fivpe kkqvtvldigdayftipldpdyapytaftlprknnagpgrrfvwcslpqg
pol_caevc kkhvtildigdayftiplyepyreytcftllspnnlgpckryywkvlpqg
pol_biv27 cehltaidikdayftiplhedfrpftafsvvpvnregpierfqwnvlpqg

pol_sivai wkgsptifqntaanileeikrhtpgleivqymddlwlasdhdetrhnqqv
pol_sivgb wkgspcifqgtvasllevfrknhptvqlyqymddlfvgsdytaeehekai
pol_fivpe wilspliyqstldniiqpfirqnpqldiyqymddiyigsnlskkehkekv
pol_caevc wklspsvyqftmqeiledwiqqhpeiqfgiymddiyigsdleikkhreiv
pol_biv27 wvcspaiyqtttqkiienikkshpdvmlyqymddlligsnr--ddhkqiv

pol_sivai divrkmllekgletpdkkvqreppwewmgyklhpnkwtinkielppleg-
pol_sivgb velrallmtwnletpekkyqkeppfhwmgyelhpdkwkiekvqlpelae-
pol_fivpe eelrklllwwgfetpedklqeeppytwmgyelhpltwtiqqkql-dipe-
pol_caevc kdlanyiaqygftlpeekrqkgypakwlgfelhpqtwkfqkhtlpeltkg
pol_biv27 qeirdklgsygfktpdekvqeer-vkwigfeltpkkwrfqprqlk-ikn-

pol_sivai ewtvnkiqkvvgvlnwasqiypgiktkhtcamlrgkknlleeivwteeae
pol_sivgb qptvneiqklvgklnwaaqlypgiktkqlcklirgglnitekvtmteear
pol_fivpe qptlnelqklagkinwasqaipdlsikaltnmmrgnqnlnstrqwtkear
pol_caevc titlnklqklvgelvwr-qsiigksipnilklmegdrelqserkieevhv
pol_biv27 pltvnelqqlvgncvwvqpevk-iplypltdllrdktnlqekiqltpeai

pol_sivai aeyknnqgivqetqegtyydplkeliatvqkqgegqwtyqftqeg--avl
pol_sivgb leyeqnkeilaeeqegsyydpnkelyvrfqkttggdisfqwkqgn--kvl
pol_fivpe levqkakkaieeqvqlgyydpskelyaklslvgphqisyqvyqkdpekil
pol_caevc keweacrkkl-eemegnyynkdkdvygqlaw-gdkaieyivyqekg-kpl
pol_biv27 kcveefnlklkdpewkdriregaelvikiqmv-prgivfdllqd-g-npi

pol_sivai kvgryakqrethtndlrtlahlvqkickealtiwgrlprvqlpvdkktwd
pol_sivgb ragkygkqktahsndlmklagatqkvgresiviwgfvpkmqipttreiwe
pol_fivpe wygkmsrqkkkaentcdialracykireesiirigkepryeiptsreawe
pol_caevc wvnvvh--niknlsipqqvikaaqkltqeviirtgkipwillpgkeedwr
pol_biv27 wggvkg-lnydhsnkikkilrtmnelnrtvvimtgreasfllpgssedwe

pol_sivai m-wwqdywqvswipewefvstpllvklwy--slvk-epikgedvyyvdga
pol_sivgb d-wwheywqctwipevefistpmlerewy--slsp-eplegvetyyvdga
pol_fivpe snlinspylkapppeveyihaalnikral--smikdapipgaetwyidgg
pol_caevc lelqlgnitwmpkfwscyrg--ht--rwrkrniie-evveg-ptyytdgg
pol_biv27 aalqk-eesltqifpvkfyrhs-c--rwt--sicg-pvrenlttyytdgg

pol_sivai askvtklgkagylsergksrirelenttnqqaeltavkmaledsgenvni
pol_sivgb anrdskmgkagyitdrgfqrveeylnttnqqtelhavklaledsgsyvni
pol_fivpe r-klgkaakaaywtdtgkwrvmdleg-snqkaeiqalllalkagseemni
pol_caevc --kknkvgslgfivstgekf-rkheegtnqqlelraieealkqgpqtmnl
pol_biv27 --kkgktaaavywce-grtkskvfpg-tnqqaelkaicmalldgppkmni

pol_sivai vtdsqyvmniltacpq-es-nsplveqiiqalmkkrqvylqwvpahkgig
pol_sivgb vtdsqyvvgilasrpt-et-dhpivkeiielmkgkekiylswlpahkgig
pol_fivpe itdsqyviniilqqpd-mm--egiwqevleelekktaifidwvpghkgi-
pol_caevc vtdsryafefllrnwdeeviknpiqarimeiahkkdrigvhwvpghkgi-
pol_biv27 itdsryayegmreepe-twaregiwleiakilpfkqyvgvgwvpahkgig



